상부 소화관 내시경 검사는 매우 안전한 검사이나 드물게 합병증이 생길 수 있습니다.
합병증으로는 다음과 같은 것이 있습니다.

1. 소화관 천공 : 식도 입구부위에 천공이 생길 수 있습니다. 내시경 삽입시 식도 입구부위가 가장 흔히 발생하며, 그 외 검사 중 심한 구토시, 위내 이물질 제거시 등 발생할 수 있습니다.

2. 출혈 : 진단 목적의 검사시에 출혈성 경향이 있거나 항응고제 등의 약을 복용하는 환자의 경우 생검 후 발생할 수 있습니다. 대부분은 치료 내시경 후 발생합니다.

3. 급성 위점막 병변 : 내시경 검사 일부에서 드물게 발생합니다. 내시경 검사 3~7일 후 심와부 동통, 구토, 출혈 등의 증상이 발생하는 경우 의심할 수 있습니다.

4. 캄톤 주머니 : 검사 후 귀밑 이하선 부위가 부어오르고 압통이 생기는 경우가 있습니다. 5~6시간 후에 저절로 가라앉습니다.

5. 그 외
악관절 부종, 피하부종, 비출혈 등이 있습니다.

전처치에 사용하는 국소마취제에 대한 과민반응이 있을 수 있으며, 부교감신경 차단제 주사로 녹내장, 전립선 비대증 등이 일시적으로 악화 될 수 있습니다.

하지만, 숙련된 의사가 시행시 그 합병증 발생은 매우 드물며 대부분 검사시 또는 검사 직후 발견이 가능합니다. 합병증의 발생을 줄이기 위해서는 사전에 의사와 충분히 상담하여 자신의 병력이나 약물력을 잘 알리는 것이 중요합니다.