모든 치료 방법에 부작용이 있듯이 수혈이라는 치료 방법에도 부작용이 생길 수 있습니다. 용혈성 수혈 부작용은 ABO 혈액형이 맞지 않는 혈액을 수혈한 경우 생길 수 있는 부작용입니다. 이를 예방하기 위하여 수혈할 때마다 혈액형 검사와 교차시험을 철저하게 시행하고 있습니다. 용혈성 수혈 부작용이 의심될 때는 즉시 수혈을 중지하여야 합니다. 발열성 수혈 부작용은 수혈에 의해 오한과 발열이 나는 경우를 말합니다. 대략 1-2%의 환자에서 생길 수 있는데 해열제를 쓰면 쉽게 좋아집니다. 어떤 환자들은 수혈 후 두드러기가 생기는 알레르기성 수혈 부작용이 생길 수 있습니다. 이것은 대부분 경미하므로 수혈을 중지할 필요까지는 없습니다. 수혈로 인해 B형 또는 C형 간염에 감염될 수 있습니다. 그리고 우리나라에서는 아주 드물지만 에이즈(AIDS)에 감염될 수도 있습니다. 수혈에 의한 간염이나 에이즈를 예방하기 위해서는 우선 건강한 사람만이 헌혈하도록 해야 합니다. 그러나 아무리 검사를 철저히 하여도 간염 또는 에이즈 바이러스에 감염 초기에는 검사해도 정상으로 나올 수 있으므로 100% 안전한 수혈은 어렵습니다.